La conservación de las poblaciones de aves es un objetivo clave para la gestión del ecosistema del Delta del Sacramento-San Joaquín y es probable que tenga efectos mucho más allá de sus límites. Con el fin de fundamentar las estrategias de conservación de las aves, identificamos Áreas Prioritarias de Conservación de Aves para las aves terrestres ribereñas y las aves acuáticas en el Delta, definidas como el 5% más valioso del paisaje para cada grupo. Sintetizamos los datos de 2.547 censos de aves terrestres ribereñas y 7.820 censos de aves acuáticas para desarrollar modelos predictivos de distribución, que sirvieron de base para los análisis de priorización espacial. Identificamos un total de 26.019 ha de alta prioridad para la conservación de aves terrestres ribereñas, aves acuáticas, o ambas, que representan los lugares más importantes del Delta para proteger y gestionar, así como áreas estratégicas donde la restauración adyacente podría ampliar el hábitat valioso. Estas áreas prioritarias para la conservación de las aves incluyen el área de vida silvestre de Yolo Bypass, la reserva del río Cosumnes, el refugio nacional de vida silvestre de Stone Lakes y las zonas de amortiguación que rodean el distrito regional de saneamiento del condado de Sacramento. Sin embargo, también descubrimos que más del 60% de las Áreas Prioritarias para la Conservación de las Aves no están protegidas en la actualidad, lo que indica una vulnerabilidad a los cambios en la cubierta o el uso del suelo. Recomendamos avanzar en las estrategias de conservación de aves en el Delta mediante el desarrollo de objetivos y prioridades más específicos, la ampliación de estos análisis para incluir otras especies de aves y la planificación para mitigar la pérdida de Áreas Prioritarias para la Conservación de Aves allí donde sean más vulnerables a los cambios en la ocupación del suelo. Los modelos predictivos y el marco de análisis que hemos desarrollado representan el estado actual de la ciencia en áreas importantes para la conservación de las aves, a la vez que proporcionan una base para una estrategia de conservación de las aves en evolución que refleje la base de conocimientos y el paisaje en continua evolución del Delta.